異常現象(戦闘中)コントローラー使用で 
 
敵が一度に複数登場する戦闘に於いて、回避ボタン及びペッパーミル、ポットの切り替えボタンが押しても反応しないケースが
 多々見られます、プログラム上、戦闘の処理に時間を取られ、入力監視が疎か(後回し?)に成っているのではと言う感じです。
★不具合発生(断りの無い限り、毎回発生する訳ではない)
共通事項:敵を全部倒したのにゲームが進展しない場合、敵が透明化していて攻撃もしてこないため、倒せないでいる場合があります。
 
ミルで無差別に周囲を撃ちまくって反応が有るとか、また、歩き回って透明障害物に当たればそこに存在します、
 
馬で叩くと攻撃が通じたり、実体化する場合も多いのでそうなれば攻撃が通じるようになります。
 
やり直しを選択する前に試してみると良いです、見つからない(居ない)場合はやり直しになります。

第1章
マッドハッターの領地
 敵を全部始末したにも関わらず、戦闘音楽が鳴り止まず、次に展開しない。
 (メニューに戻り、やり直しを選択、それでもだめなら、ゲームを終了し、ゲームを再起動してゲームを続ける)

 圧力プレートを押すと浮上する歯車足場が浮上せず、進めない。
  (間を置いて、時限爆弾を置きなおす)最初圧力プレートに乗った後、降りてしまって爆弾を置きなおしたときに成る場合がある。
  スイッチから降りると、歯車足場が下がるが、下がりきらない内に爆弾を置きなおしたときに成るようです。

 圧力プレートを押すと入り口の扉が開くところで、開かない。
 (間を置いて、時限爆弾を置きなおす)最初圧力プレートに乗った後、降りてしまって爆弾を置きなおしたときに成る場合がある。

第2章
欺きの底-(オイスターガーデン)
 最初の牡蠣のベッドが有る所で、蟹を3匹倒すと進展するのだが、3匹目が現れない、
 実際は透明で現れているが、攻撃してこないので解からない、歩くと見えない障壁にツッカカル、
 ペッパー、ナイフで反応有れば居る、馬でそこを殴り倒せば死んで姿を現す。

欺きの底-(三つの墓地で三つ目、白いタツノオトシゴについて行く時)
 落ちてしまって再挑戦の時、圧力プレートを押すと浮上する透明床が浮上しない事がある。
(最初の床が浮上しないときは最後(ジャンプきのこ手前)の床も浮上していないので通常ルートではジャンプきのこに届かない)
 (一旦落ちて死んで、時限爆弾を置きなおす、浮上するまで繰り返す)
 又は、足場出ない状態のとき、無視して奥の透明床(正常時の2番目の床)に行き、アイテム-瓶のある床に行く、
 そこから直接、浮遊を有効に使ってジャンプきのこに行く。
(この時タツノオトシゴから離れるためダメージを受けるのでライフ少ない時には無理)

欺きの底-(再びバレムボトム)
 門に入る手前のラデュラルーム「やられる前に殺れ」でアイポットの内、何体かが、胡椒目潰し、爆弾で怯まないことがある。
 
(ナイフか馬で一度、殴ると(目でなくても良い模様)、その後は胡椒目潰し、爆弾で怯む様になる)
 
(複数が成った時も1体をやれば他も怯む様になる模様)

第3章
東洋の森(破滅の谷)
 終盤、花の右方浮き岩に透明なブタ鼻が有る所の、コロッサルルインが無敵になりゲームが進まない。
 
(メニューに戻り、やり直しを選択)

東洋の森(ミステリアス・イースト/トランク)
 鍵穴の前で石像が上下している鍵穴を抜けた場面で(セーブが入る)、アーチャーワスプが現れず、サムライワスプを倒しても
  前方の石造の口が開かず、ゲームが進まない。
 
(メニューに戻り、やり直しを選択してもだめで、ゲームを終了し、ゲームを再起動してゲームを続けるで正常になった)

第4章
クイーンズランド
 最初の城門を入ったところでトランプ兵との戦闘後、戦闘音楽鳴り止まず、ムービーに進まない、結果白の王を破壊できず
  ゲームが進められない、
 
(メニューに戻り、やり直しを選択してゲームを続ける)

 死刑執行人以外の敵を全部始末すると、出口の壁が破壊可能に成る場面でインシディアスルインが置物化し、
 倒せないので逃げられない。
 
(メニューに戻り、やり直しを選択、それでもだめなら、ゲームを終了し、ゲームを再起動してゲームを続ける)
 
確定ではないが、予防として、トランプ兵より、インシディアスルインの始末を先にした方が、ならない気がする。

 死刑執行人以外の敵を全部始末すると、アリスが穴に落とされる場面なのに、落とされないのでゲームが進まない。
 
(メニューに戻り、やり直しを選択、それでもだめなら、ゲームを終了し、ゲームを再起動してゲームを続ける)

第5章
ドールハウス(首をはねてしまえ!その1)
 冒頭、頭のヨコに、小さなアリスの姿が有って、頭は動かせずゲームが進めない(アリスは動く)。→スクリーンショット
 
(メニューに戻り、やり直しを選択してゲームを続ける)

 (首をはねてしまえ! その2)
 ピンボール終了後滑り台の終点、メナシングルインとドールガール2体が出るところで、ドールガール1体しか出ず、透明な敵から
  攻撃を受ける(出現するはずのもう1体のドールガール)やり直しでは改善せず、ゲーム再起動。
  透明物に突き当たったらホビーホースで殴れば倒せるが、攻撃を見極めて回避することが不可能なので、低難易度の場合しか
  生き残れないでしょう。

ドールハウス(レジスタンス砦開放)
布張り広場で最後のコロッサルルイン、スリザリンルインとの戦闘。
 コロッサルルインが最初顔を出してすぐに顔を引っ込めてしまい、その後顔を出さないので倒せない。
 (コロッサルルインが攻撃して来ない)
 やり直し及び、一旦メインメニューに戻ってゲームを続けるを行っても改善しない、ゲーム再起動で正常に戻った。

プレーヤーに有利な不具合発生(断りの無い限り、毎回発生する訳ではない)
第1章
マッドハッターの領地-(精錬&逆流)
 溶融金属を冷やすバルブを操作するためジャンプキノコでバルブの有る床に上がった時、インシディアスルイン2体が出現するが
 無視してすぐバルブに行き操作すると、ムービー終了後ルインが消滅している。(毎回発生)
 小技集-精錬&逆流 参照

マッドハッターの領地(精錬&逆流)
 2周目中、溶融金属を冷やすバルブを操作し冷えた後、メナシング・ルインとの戦闘で気づいたが、
 アリスが通常姿で不死身になっていた。
 ルインの火球はアリスを通り抜けてしまうし、他の攻撃もダメージを受けない、だが、傘を開いても、
  火球は傘とアリスを通り抜けて跳ね返さない。
 よってルインの白い腕が破壊できない、2周目なのでホビーホースがあるので殴りまくって顔を破壊できたが、一周目だったら
  爆弾破裂させて、一瞬白い手を開いた間に切るしかない、ただし、ここは無視して進むことも出来るので、ゲームは進められる。
 次のセーブポイント通過後は不死身では無くなっていた。

第3章
東洋の森(僧院の谷の最終盤、赤色の舌を出しているような扉が有る建物に至る手前の場所)
 滑り台を終え、圧力プレートに時限爆弾を置いて足場経由で上がり、鎖を引く、足場経由し、時限爆弾を置いて
  足場2箇所経由した先、ワスプが現れるが2匹目のワスプが途中で消滅する。

破滅の谷(最後、コロッサルルイン、ドリフティングルイン、インシディアスルインが出現する所)
 見えない豚鼻を撃って出る浮遊岩場及び透明床から攻撃した場合、
 ドリフティングルイン2体、インシディアスルイン3体を倒した所でオートセーブが入り戦闘クリアとなる場合が高率で発生する。
 小技集-破滅の谷の最後 参照

第5章
ドールハウス(フロッグ通り)
1A.
頭が乗った6番建物が有る(ドリフティングルイン3体、ド−ルガール、メナシングルインが出現する)布張り広場)、
   
壁を壊して出た広場に降りる前(前方にブランコが有る)足場にて
   ドリフティングルイン2体、ド−ルガールを倒した時点で戦闘終了と成り、建物が開き階段が出現する。

1B.
壁を壊して出た広場に降りる前(前方にブランコが有る)足場にてドリフティングルイン2体、ド−ルガールを倒した後、
   足場の左端から広場に降りすぐ左奥へ行き3体目のドリフティングルインを倒した場合、建物が開き階段が出現する。

1C.
壁を壊して出てすぐ広場に降りて戦闘となった場合
   全敵を倒さないうちに、戦闘終了と成り、建物が開き階段が出現する。