今更の感が有りますがVistaの項目がなかったので検証しました。
Windows Vistaは初期の32bit版しか購入していませんので（Vistaが登場した当時は64bitソフトがほとんど普及していなかったため）、
　64bit版は未確認ですが、Win7からWin8.1の動作から見て、同様と思われます。
WindowsはXPサポート終了まで使い続け、Win7に移行サポート終了まで使い続け、Win10に移行しました。（Vista/8/8.1は実用使用無し）

Windows UpDate でKB3086255が適用されるとオリジナル状態（起動にCDが必要）では起動しなくなります。
対処法の1つ（試していません、情報のみ）
KB3086255の適用で無効となるsecdrv.sys ドライバーのサービスをゲーム時だけ有効に戻す。以下「microsoft」のサポートページ参照
https://support.microsoft.com/ja-jp/kb/3086255

対処法の1つ
KB3086255を削除する（自己責任で）

対処法の1つ（アリス・イン・ナイトメアをプレーするだけならこの方法が１番簡単）
NoCDの「alice.exe」に置き換えることでＣＤ不要で起動します。
↓アリス・イン・ナイトメア日本語版用NoCDパッチ配布所
http://2chknight298.tripod.com/AIN.html

その他
　一般のSafeDisk使用ゲームの対処法のサイト紹介
***************************************************************************************************************************
KB3086255適用する前
Windows Vista でもアリス イン ナイトメアをプレーできました。
最初、OSの持つドライバーではグラフィックが標準VGAに成っていて、OpenGLエラーでコンソール画面でストップ。
マザーボード付属のCDにVista用ドライバーは無かったが、Win7用ドライバー導入でHD 3000に成り、正常にゲームが起動した。

「config.cfg」ファイルと「save」フォルダの場所については→こちらに記載

KB3086255を適用するとオリジナル状態（起動にCDが必要）では起動しなくなります。
***************************************************************************************************************************
EA BEST版および初期２枚組版インストールでの確認。
OSをクリーン・インストールし、SP2まで適用した段階でHDDイメージをバックアップし、
アリスインストール前にレストアして同条件で確認。

マザーボード　ASUS　P8Z77-V Pro
CPU　　　　　 i7 2700K　3.5GHz
GPU　 　　　　CPU内臓　Intel HD Graphics 3000
サウンド 　　 オンボード
OS　　　　　　Windows Vista Ultimate SP2　32bit版

*************************************************************************************************************************